Die drei Hauptsäulen der Tierphysiotherapie sind Schmerzlinderung, Prävention und Rehabilitation. Zu ihren Schwerpunkten zählen die Erhaltung bzw. Wiedererlangung der Gelenkmobilität, Muskelaufbau und -erhalt, Minderung von Lähmungserscheinungen und Schmerzbeseitigung.

Desweiteren kann die Tierphysiotherapie bei fast allen Muskel-, Gelenk-, Sehnen-, Bänder- und Nervenproblemen zum Einsatz kommen.